Na temporada anterior, as rivalidades foram colocadas de lado para vencer a equipa do impiedoso Terry Silver. Contudo, o terrível John Kreese finge a sua morte e, assim, consegue fugir da prisão, esperando-se que vá procurar vingar-se de Daniel e Johnny. Entretanto, e na sexta e última temporada, os mestres e alunos do dojo Cobra Kai tentam arranjar uma forma de competir no Sekai Taikai, o campeonato mundial de karaté.